结束宝岛激战，千空等人平安返回科学王国。用到手的石化装置，成功让狮子王司复活。司成为科学王国的伙伴！并且，千空等人查明了人类石化的幕后黑手·怀曼，他的根据地是月球，于是千空等人以月球为目标前进！
在这个石头世界里，他们开始了从零开始制作宇宙飞船的大项目。很快，为了从世界各地收集宇宙飞船的素材，千空等人乘坐珀尔修斯号驶向大海。
为了寻找大量的玉米作为复活液的原料，他们以最初的目的地美洲大陆为目标。
在考验勇气、团结、科学力等一切的大航海前方，等待着千空等人、对他们造成威胁的是——！！
千空等人的冒险终于向世界、以及宇宙展开行动！为了拯救人类的未来，千空与同伴们一起全力开拓科学之道！！